Utilizziamo i cookie per migliorare la tua esperienza.Continuando a navigare su questo sito acconsenti all'uso dei cookie da parte nostra.Ulteriori informazioni.Un articolo in fase di revisione sulla rivista Scientific Reports e attualmente disponibile sul server della pubblicazione preliminare di Research Square* riporta l'acido cicorico (CA) come potenziale inibitore della sindrome respiratoria acuta grave coronavirus 2 (SARS-CoV-2).Studio: Scoperta e caratterizzazione strutturale dell'acido cicorico come legante proteico del nucleocapside SARS-CoV-2 e disgregatore di legame dell'RNA.Credito immagine: NIAIDC'è ancora un bisogno medico critico di farmaci nuovi e mirati in grado di combattere le infezioni da SARS-CoV-2.Stabilire tali agenti antivirali, nella maggior parte dei casi, richiede la conoscenza della funzione e della struttura di possibili bersagli virali e l'identificazione e la profilazione di siti di attacco modulatori di piccole molecole in queste proteine che consentono tecniche di progettazione di farmaci basati sulla struttura (SBDD).La proteina del nucleocapside (N) SARS-CoV-2 è un obiettivo importante per lo sviluppo di nuovi antivirali poiché è essenziale per la trascrizione e il confezionamento del genoma CoV.La proteina N è espressa più frequentemente nelle cellule infette.Tuttavia, non è stato ampiamente utilizzato come bersaglio per lo sviluppo di farmaci anti-SARS-CoV-2, in contrasto con le proteine strutturali dell'involucro (E) e del picco (S).In effetti, i dati strutturali sul legame del ligando della proteina N sono limitati.Nel presente studio, i ricercatori del Centro brasiliano per la ricerca in energia e materiali e l'Università statale di Campinas hanno utilizzato un nuovo test di screening ad alto rendimento (HTS) basato sulla polarizzazione della fluorescenza per scoprire piccoli composti che interferiscono con la capacità della proteina N di si legano a un RNA specifico, cioè RNA1, ottenuto dal segnale di impacchettamento del genoma SARS-CoV-2 (PS).Per sviluppare un'analisi per riconoscere i possibili inibitori della capacità di legame dell'RNA della proteina N, il team ha cercato un RNA bersaglio della proteina N che impiegasse la sequenza PS SARS-CoV-2 come candidato.Un test di polarizzazione della fluorescenza (FP) utilizzando diversi RNA marcati con 5'-fluoresceina isotiocianato (FITC) come bersagli ha monitorato le attività di legame dell'RNA della proteina N.Gli scienziati hanno utilizzato un test FP per eseguire un esperimento HTS esaminando una libreria di circa 3200 farmaci e composti bioattivi autorizzati.Sono stati condotti studi di concentrazione-risposta utilizzando le molecole preselezionate per verificare l'efficacia dei candidati di successo come inibitori del contatto proteina N-RNA1.La risonanza magnetica nucleare della differenza di trasferimento di 1H-saturazione (1H-STD NMR) e la calorimetria di titolazione isotermica (ITC) sono state utilizzate per esaminare ulteriormente le caratteristiche di CA come ligando per la proteina N.Gli autori hanno stabilito la struttura cristallina del dominio C-terminale (CTD) della proteina N accoppiato con CA per far luce su come il CA si lega alla proteina N.Hanno cercato di vedere se la CA può prevenire l'infezione da SARS-CoV-2 in vitro dopo aver convalidato la CA come ligando della proteina N con probabili conseguenze sulla sua attività di attacco dell'RNA.Nella valutazione delle piccole molecole bioattive si sono distinti composti immensamente polari, in particolare polifenoli come acido chebulinico (CI), ellagitannini, punicalina (PL) e punicalagina (PG), nonché diesteri dell'acido tartarico, come CA, e naftiluree polisolfonate come suramina (SUR).Queste ultime sostanze hanno interferito con il contatto di una sonda di RNA generata dalla sequenza PS SARS-CoV-2, RNA1 e dalla proteina SARS-CoV-2 N a lunghezza intera a livello submicromolare.La struttura cristallina dell'acido cicorico (CA) di legame della proteina CTD SARS-CoV-2 N rivela una rete di contatti polari e riaggiustamenti strutturali per accogliere il ligando simmetrico nel sito di legame della proteina CA-N.A) Rappresentazione a cartoni animati della struttura cristallina del dimero CTD della proteina N raffigurante i suoi elementi di struttura secondaria (in blu), tra cui due eliche 310 (η), cinque α-eliche e due filamenti β antiparalleli e il sito di legame CA (riquadro evidenziato dal quadrato tratteggiato blu).B) Sito di legame CA dettagliato dal riquadro A. La molecola CA è rappresentata come bastoncini (arancione) con la sua mappa della densità elettronica in blu.CA si lega a una tasca poco profonda formata tra le α-eliche 1-2 e η-elica 2, vicino al C-terminale (C-Ter).C) Interazioni atomiche di CA con i residui della proteina N.I gruppi carbossilici CA sono a distanze ideali per impegnare interazioni elettrostatiche e legami idrogeno con la catena laterale Arg276 (atomo NH1), l'ammina della catena principale Arg277 e una molecola d'acqua strutturale (W288) stabilizzata da Arg276 NH2.Thr271 e Gln289 possono posizionare ulteriormente i donatori di legami idrogeno (Thr271O�� e una molecola d'acqua strutturale, W478, stabilizzata dal carbonile Gln289) per impegnare un'interazione simmetrica con i gruppi carbonilici di entrambe le unità caffeoiliche di CA.Uno dei motivi catecolici di CA è ben sistemato vicino al C-terminale Pro364, mostrando una densità elettronica ben definita (pannello video B).D, E) Sovrapposizione del sito di legame CA nella proteina N nativa CTD (bastoncini blu, PDB ID 7UXX) e nel complesso CTD della proteina CA-N (bastoncini grigi (PDB ID 7UXZ)) evidenziando riaggiustamenti strutturali indotti dal legame CA (evidenziato dalle frecce rosse).I dati sono stati generati con Pymol (Schroedinger Inc.).I contatti polari sono indicati da linee tratteggiate con le distanze misurate in Angstrom.Gli atomi di ossigeno sono mostrati in rosso, gli atomi di azoto in blu.Le molecole d'acqua sono rappresentate come sfere rosse.CI, PL, PG e SUR sono stati descritti in precedenza per mostrare diverse caratteristiche biologiche, inclusa l'azione antivirale.Tuttavia, la CA è stata evidenziata come una nuova classe di modulatori della proteina N e uno dei composti di successo più efficaci scoperti negli attuali studi HTS.I risultati hanno dimostrato che CA era un ligando di affinità per la proteina N che si lega al CTD ed espelle l'RNA dalla proteina N a livelli micromolari.Il team ha scoperto che CA sopprime la moltiplicazione SARS-CoV-2 nella coltura cellulare a concentrazioni micromolari, che era compatibile con i valori della costante di dissociazione (KD) per la dissociazione della proteina N e del complesso RNA1.Secondo gli autori dello studio, la presente ricerca è stata la prima caratterizzazione di un ligando non endogeno per la proteina SARS-CoV-2 N e il resoconto iniziale di questa posizione di legame del ligando modulatorio sulla proteina CoV N.Nel presente studio, gli scienziati hanno descritto un nuovo test HTS basato sulla fluorescenza che consente la scoperta di piccoli composti che ostruiscono la capacità della proteina SARS-CoV-2 N di legare l'RNA.Hanno utilizzato una serie di studi biofisici per caratterizzare i migliori successi.I ricercatori hanno risolto per la prima volta la struttura cristallina del ligando non endogeno che lega la proteina N CTD, illuminando una nuova regione modulatoria nella proteina N SARS-CoV-2.In particolare, la regione di legame CA è stata conservata nella SARS-CoV e in parte conservata nelle proteine N della sindrome respiratoria del Medio Oriente (MERS).I dati attuali forniscono la base strutturale per la progettazione razionale e la creazione di nuovi farmaci antivirali che affrontano la proteina SARS-CoV-2 N, un obiettivo rilevante e ancora non studiato dei CoV, nonostante la necessità di un ulteriore perfezionamento del CA come agente antivirale.I preprint con Research Square pubblicano rapporti scientifici preliminari che non sono sottoposti a revisione paritaria e, pertanto, non devono essere considerati conclusivi, guidano la pratica clinica/comportamento relativo alla salute o trattati come informazioni consolidate.Pubblicato in: Notizie di ricerca medica |Notizie su malattie/infezioni |Notizie FarmaceuticheTags: Saggio, Cellula, Coltura cellulare, Coronavirus, Malattia da coronavirus COVID-19, Efficacia, Elettrone, Fluorescenza, Genoma, Elica, Screening ad alto rendimento, in vitro, Legante, Molecola, Ossigeno, Proteina, Ricerca, Respiratorio, RNA, SARS , SARS-CoV-2, Respiratorio acuto grave, Sindrome respiratoria acuta grave, Piccole molecole, Sindrome, Titolazione, TrascrizioneShanet Susan Alex, una scrittrice medica, con sede in Kerala, India, è laureata in Farmacia presso la Kerala University of Health Sciences.Il suo background accademico è in farmacia clinica e ricerca, ed è appassionata di scrittura medica.Shanet ha pubblicato articoli sull'International Journal of Medical Science and Current Research (IJMSCR), sull'International Journal of Pharmacy (IJP) e sull'International Journal of Medical Science and Applied Research (IJMSAR).Oltre al lavoro, le piace ascoltare musica e guardare film.Utilizza uno dei seguenti formati per citare questo articolo nel tuo saggio, documento o rapporto:Susan Alex, Shanet.(2022, 06 luglio).L'acido cicorico è un potenziale candidato per il trattamento del COVID-19.Notizie-medico.Estratto il 29 luglio 2022 da https://www.news-medical.net/news/20220706/Chicoric-acid-a-potential-candidate-for-COVID-19-treatment.aspx.Susan Alex, Shanet."L'acido cicorico un potenziale candidato per il trattamento di COVID-19".Notizie-medico.29 luglio 2022.